民國三十八年政府播遷來台,中醫師公會全聯會亦相隨來台,延續會務工作運行,於是全省各縣市中醫師,依據醫師法,醫師非經加入公會不得執業。在當時高雄市為台灣省轄區內,本市同道先進劉俊鏞、韓炳均、曾金水...醫師,奔走籌備,於民國三十八年三月十七日召開會員籌備大會,由劉俊鏞當選第一屆理事長,並報請高雄市政府審查通過,頒發高民社字第一四九號立案證書。 本會自成立至今,已近五十九年,由於歷屆理事長卓越領導下,對於本會務之推動,中醫前途之發展,會員權益之爭取,不遺餘力之經營,不斷向政府有關單位陳情及抗議對中醫不平等待遇。方獲得開放中醫勞保、公保及參與全民健保醫療業務和中醫總額,得來不易,誠懇的呼籲中醫同道,要常懷感恩,惜福之心,疼惜我們中醫總額支付制度並期望永續經營。

歷史沿革:
民國38年3月17日
本會成立於高雄市
民國38年3月
劉俊鏞醫師當選第一屆理事長
民國40年3月
趙江波醫師當選第二屆理事長
民國42年3月
楊瑞宙醫師當選第三屆理事長
民國44年3月
陳教民醫師當選第四屆理事長
民國46年3月
李雲普醫師當選第五屆理事長
民國48年3月
劉添財醫師當選第六屆理事長
民國50年3月
陳天樂醫師當選第七屆理事長
民國52年3月
許誠俊醫師當選第八屆理事長
民國54年3月
黃應東醫師當選第九屆理事長
民國56年3月
李秋田醫師當選第十屆理事長
民國59年3月
張漢禎醫師當選第十一屆理事長
民國62年3月
黃應東醫師當選第十二屆理事長
民國65年4月
蘇聰明醫師當選第十三屆理事長
民國66年7月
高雄市改制為院轄市
民國68年7月
蘇聰明醫師當選改制臨時理監事會理事長
民國71年12月
巫水生醫師當選第一屆理事長
民國72年3月
自強ㄧ路會館落成啟用
民國75年3月
巫水生醫師連任第二屆理事長
民國78年3月
黃道源醫師當選第三屆理事長
民國81年3月
陳神發醫師當選第四屆理事長
民國84年3月
陳神發醫師連任第五屆理事長
民國85年8月
明華路新會館落成啟用
民國87年3月
何永成醫師當選第六屆理事長
民國90年3月
何永成醫師連任第七屆理事長
民國93年3月
張廷堅醫師當選第八屆理事長
民國96年3月
張廷堅醫師連任第九屆理事長
民國99年3月
陳福展醫師當選第十屆理事長
民國102年3月
陳福展醫師連任第十一屆理事長
民國105年3月
陳建霖醫師當選第十二屆理事長
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